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现有Allen的病毒扩散模型SIRS的马尔科夫过程程序,求指导
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由Allen编写的SIRS模型的马尔可夫过程如下:
for k=1:4 % 解马尔科夫链的样本轨迹 clear t s i r t(1)=0; i(1)=i0; s(1)=N-i0;r(1)=0; j=1; while i(j)>0 && t(j)<time % Stop hits zero or at time nn=s(j)+i(j)+r(j); u1=rand;u2=rand; den=((beta/nn)*i(j)*s(j)+gam*i(j)+alpha*i(j)+delta*r(j));%所有patch的概率之和 t(j+1)=-log(u1)/den+t(j); % Time to next event e1=(beta/nn)*s(j)*i(j)/den;%以下是每个patch概率与总概率之比 e2=e1+gam*i(j)/den; e3=e2+alpha*i(j)/den; e4=e3+delta*r(j)/den; if (u2<=e1) %每个patch情况下的个体变化情况 s(j+1)=s(j)-1; i(j+1)=i(j)+1; r(j+1)=r(j); elseif (u2>e1 && u2<=e2) s(j+1)=s(j); i(j+1)=i(j)-1; r(j+1)=r(j)+1; elseif (u2>e2 && u2<=e3) s(j+1)=s(j); i(j+1)=i(j)-1; r(j+1)=r(j); else s(j+1)=s(j)+1; i(j+1)=i(j); r(j+1)=r(j)-1; end j=j+1; end (省略出图部分) end 本人菜鸟,对上述标黄部分的分支概率不太理解,变量“den”是各个转换概率之和,e1-e4分别是四种转换概率与“den”的比值,请问各位大神,e1-e4的顺序有区别么?另附本程序的转换图,见“SIR模型”图,若想在本程序的基础上,改写成“SIRP模型”图所应用的程序,应该怎么写呢? 目前存在两个问题:1.S→I之间有两种转换概率的情况该怎么解决呢? 2. P作为独立变量,对S→I有影响,但其增加或减少的变动情况与S,I,R相对独立,P的每一步数量应该单独统计么? 感谢各位!论文卡在这里很久了,请大家帮忙。 [ATTACH]3388[/ATTACH] [ATTACH]3389[/ATTACH] |
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