您认为什么是生物信息学的最佳语言？

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我已经在生物信息学领域完成了一些研究工作，并使用Matlab进行了研究。 Matlab有很多强大的工具，并且易于使用。我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为最好的是什么？或可能没有一种特定的语言，但有几种语言最适合用于数学运算繁重且处理大量数据的生物信息学工作。



回答：

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对于我们大多数生物信息学家来说，这包括Python，R，Perl和bash命令行实用程序（例如sed，awk，cut，sort等）。也有人用Java，Ruby，C ++和Matlab进行编码。

那么底线呢？无论哪种语言，使您最轻松地完成工作都适合您。回答这个问题应该包括对库和可以从中提取的其他代码的仔细调查，以及有关您自己的喜好和经验的信息。如果您要进行微阵列分析，很难击败R /生物导体库，但是对于处理大多数类型的大型测序数据集的人来说，这绝对是错误的语言。



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