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2019-12-10, 16:49
有人在那里使用MATLAB的javaObject()函数和使用JNI的JAR文件吗？
我正在尝试使JHDF5运行，当它尝试使用jhdf5.dll进行访问时似乎炸弹，所以我真的不知道下一步该怎么做。 :(
编辑 ：我不试图读取基本的HDF5文件。我有自己的自定义Java代码，该代码可对HDF5执行某些操作，并且需要JHDF5库。另外，我的第一个问题是，是否有人成功使用过它。如果不是这样的话，我可能正在打一场失败的战斗。如果是这样，那么至少它给了我希望。我将尝试调试，与在Eclipse下调试常规Java代码相比，这非常困难。
更新 ：好的，详细信息如下。我做了一个很短的测试课，它的失败模式与我的复杂程序相同。看来我的Java类由于某种原因无法访问HDF5静态常量。
我的MATLAB javaclasspath设置为将我的test-hdf5.jar与Test1.java（如下）包括在一起，并将文件jhdf5.jar，jhdf5.dll，jhdf5obj.jar和jhdfobj.jar包含在同一目录中。
源文件Test1.java：
package com.example.test.hdf5; import ncsa.hdf.hdf5lib.H5; import ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants; import ncsa.hdf.hdf5lib.exceptions.HDF5LibraryException; import ncsa.hdf.object.FileFormat; import ncsa.hdf.object.h5.H5File; public class Test1 { public Test1 () {} public static void main(String args[]) { Test1 test = new Test1(); if (args.length < 2) { } else if ("h5file".equals(args[0])) { test.testH5File(args[1]); } else if ("h5f".equals(args[0])) { test.testH5F(args[1]); } } public void testH5File(String filename) { H5File file; try { file = (H5File) new H5File().createFile( filename, FileFormat.FILE_CREATE_OPEN); file.close(); } catch (Exception e) { throw new RuntimeException(e); } } public void testH5F(String filename) { try { int id = H5.H5Fopen(filename, HDF5Constants.H5F_ACC_RDONLY, HDF5Constants.H5P_DEFAULT); H5.H5Fclose(id); } catch (HDF5LibraryException e) { throw new RuntimeException(e); } catch (NullPointerException e) { throw new RuntimeException(e); } } } MATLAB错误：
>> T=javaObject('com.example.test.hdf5.Test1') T = com.example.test.hdf5.Test1@c9a375 >> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') java.lang.UnsatisfiedLinkError: no jhdf5 in java.library.path at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(Unknown Source) at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Unknown Source) at java.lang.System.loadLibrary(Unknown Source) at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.(H5.java:276) at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.(HDF5Constants.java:494) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) Jul 23, 2009 10:38:16 AM ncsa.hdf.hdf5lib.H5 INFO: HDF5 library: jhdf5 resolved to: jhdf5.dll; NOT successfully loaded from java.library.path ??? Java exception occurred: java.lang.UnsatisfiedLinkError: ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit()I at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit(Native Method) at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.(H5.java:288) at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.(HDF5Constants.java:494) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) >> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') ??? Java exception occurred: java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) >> T.testH5File('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') ??? Java exception occurred: java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants at ncsa.hdf.object.h5.H5File.(H5File.java:167) at ncsa.hdf.object.h5.H5File.(H5File.java:106) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5File(Test1.java:34) 万一重要，这是我正在使用的ant构建文件。 JHDF5 .jar文件和.dll在我的lib目录中；它们被复制到创建我自己的.jar文件的dist目录中。
some libraries to use later
回答：
JHDF5在Java端使用一些愚蠢的搜索逻辑来加载dll。它可以正常工作，除非不能正常工作。与许多HDF5细节一样，底层逻辑也没有记录。
我这样做了：取得了JHDF5 Java源代码，删除了试图加载jhdf5.dll的愚蠢AI（位于ncsa / hdf / hdf5lib / H5.java文件中，位于第230-290行中的static部分），并替换为一个显式的System.load("full/path/to/the/jhdf5.dll");声明。然后重新编译jhdf5.jar。也许不漂亮，但是效果很好。
此外，查看源代码，似乎如果设置名为H5_LIBRARY_NAME_PROPERTY_KEY的系统属性以指向dll，则可能会加载它。您可以通过使用-D开关启动jvm来设置系统属性，例如：
java -DH5_LIBRARY_NAME_PROPERTY_KEY=path/to/the/jhdf5.dll -jar yourapp.jar 不过没有尝试。
更多&回答... (https://stackoverflow.com/questions/1168567)
我正在尝试使JHDF5运行，当它尝试使用jhdf5.dll进行访问时似乎炸弹，所以我真的不知道下一步该怎么做。 :(
编辑 ：我不试图读取基本的HDF5文件。我有自己的自定义Java代码，该代码可对HDF5执行某些操作，并且需要JHDF5库。另外，我的第一个问题是，是否有人成功使用过它。如果不是这样的话，我可能正在打一场失败的战斗。如果是这样，那么至少它给了我希望。我将尝试调试，与在Eclipse下调试常规Java代码相比，这非常困难。
更新 ：好的，详细信息如下。我做了一个很短的测试课，它的失败模式与我的复杂程序相同。看来我的Java类由于某种原因无法访问HDF5静态常量。
我的MATLAB javaclasspath设置为将我的test-hdf5.jar与Test1.java（如下）包括在一起，并将文件jhdf5.jar，jhdf5.dll，jhdf5obj.jar和jhdfobj.jar包含在同一目录中。
源文件Test1.java：
package com.example.test.hdf5; import ncsa.hdf.hdf5lib.H5; import ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants; import ncsa.hdf.hdf5lib.exceptions.HDF5LibraryException; import ncsa.hdf.object.FileFormat; import ncsa.hdf.object.h5.H5File; public class Test1 { public Test1 () {} public static void main(String args[]) { Test1 test = new Test1(); if (args.length < 2) { } else if ("h5file".equals(args[0])) { test.testH5File(args[1]); } else if ("h5f".equals(args[0])) { test.testH5F(args[1]); } } public void testH5File(String filename) { H5File file; try { file = (H5File) new H5File().createFile( filename, FileFormat.FILE_CREATE_OPEN); file.close(); } catch (Exception e) { throw new RuntimeException(e); } } public void testH5F(String filename) { try { int id = H5.H5Fopen(filename, HDF5Constants.H5F_ACC_RDONLY, HDF5Constants.H5P_DEFAULT); H5.H5Fclose(id); } catch (HDF5LibraryException e) { throw new RuntimeException(e); } catch (NullPointerException e) { throw new RuntimeException(e); } } } MATLAB错误：
>> T=javaObject('com.example.test.hdf5.Test1') T = com.example.test.hdf5.Test1@c9a375 >> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') java.lang.UnsatisfiedLinkError: no jhdf5 in java.library.path at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(Unknown Source) at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Unknown Source) at java.lang.System.loadLibrary(Unknown Source) at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.(H5.java:276) at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.(HDF5Constants.java:494) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) Jul 23, 2009 10:38:16 AM ncsa.hdf.hdf5lib.H5 INFO: HDF5 library: jhdf5 resolved to: jhdf5.dll; NOT successfully loaded from java.library.path ??? Java exception occurred: java.lang.UnsatisfiedLinkError: ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit()I at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit(Native Method) at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.(H5.java:288) at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.(HDF5Constants.java:494) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) >> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') ??? Java exception occurred: java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46) >> T.testH5File('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5') ??? Java exception occurred: java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants at ncsa.hdf.object.h5.H5File.(H5File.java:167) at ncsa.hdf.object.h5.H5File.(H5File.java:106) at com.example.test.hdf5.Test1.testH5File(Test1.java:34) 万一重要，这是我正在使用的ant构建文件。 JHDF5 .jar文件和.dll在我的lib目录中；它们被复制到创建我自己的.jar文件的dist目录中。
some libraries to use later
回答：
JHDF5在Java端使用一些愚蠢的搜索逻辑来加载dll。它可以正常工作，除非不能正常工作。与许多HDF5细节一样，底层逻辑也没有记录。
我这样做了：取得了JHDF5 Java源代码，删除了试图加载jhdf5.dll的愚蠢AI（位于ncsa / hdf / hdf5lib / H5.java文件中，位于第230-290行中的static部分），并替换为一个显式的System.load("full/path/to/the/jhdf5.dll");声明。然后重新编译jhdf5.jar。也许不漂亮，但是效果很好。
此外，查看源代码，似乎如果设置名为H5_LIBRARY_NAME_PROPERTY_KEY的系统属性以指向dll，则可能会加载它。您可以通过使用-D开关启动jvm来设置系统属性，例如：
java -DH5_LIBRARY_NAME_PROPERTY_KEY=path/to/the/jhdf5.dll -jar yourapp.jar 不过没有尝试。
更多&回答... (https://stackoverflow.com/questions/1168567)